Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXQ1Q9C009 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXQ1Q9C009 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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