Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CELF4Q9BZC1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms