Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC4A5Q9BY07 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms