Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms