Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms