Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUP88Q99567 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP88Q99567 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms