Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIN3AQ96ST3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms