Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms