Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP47Q96K76 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP47Q96K76 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms