Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms