Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms