Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms