Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF183Q96D59 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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