Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF3C6Q969F1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms