Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA6Q92908 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms