Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGGTAQ92696 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGGTAQ92696 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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