Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms