Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms