Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms