Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms