Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP2Q8IXW5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms