Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms