Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXIP1Q6ZW49 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms