Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TPGS1Q6ZTW0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TPGS1Q6ZTW0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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TPGS1Q6ZTW0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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TPGS1Q6ZTW0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPGS1Q6ZTW0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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