Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00299Q6ZSB3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms