Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms