Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms