Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE12Q6L8Q7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE12Q6L8Q7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms