Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf84Q5VXU9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf84Q5VXU9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms