Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC01545Q5VT33 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms