Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms