Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms