Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms