Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms