Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC57Q2TAC2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms