Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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