Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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