Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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