Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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