Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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