Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-1Q15270 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-1Q15270 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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