Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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PRKD1Q15139 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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