Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PDK1Q15118 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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