Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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