Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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