Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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