Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms