Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX2Q13950 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms