Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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