Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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